Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM187BQ17R55 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM187BQ17R55 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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