Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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