Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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