Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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