Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TCEA2Q15560 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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