Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PUM3Q15397 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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