Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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CDK5R1Q15078 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDK5R1Q15078 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CDK5R1Q15078 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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