Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms