Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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COL9A3Q14050 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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