Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms