Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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