Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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