Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms