Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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