Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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