Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms