Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PTK7Q13308 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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