Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF5Q13243 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SRSF5Q13243 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SRSF5Q13243 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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