Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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