Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CBX3Q13185 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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