Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A2Q12974 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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