Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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