Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms