Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms