Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMF1P82094 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms