Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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ACTBP60709 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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