Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms