Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC4P56524 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms