Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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KCNQ1P51787 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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KCNQ1P51787 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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KCNQ1P51787 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1P51787 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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