Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms