Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK8P49336 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK8P49336 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms