Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms