Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN4P29074 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms