Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms