Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGAMP11215 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGAMP11215 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms