Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms