Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4FO95754 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA4FO95754 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms