Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJB3O75712 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms