Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL13O43927 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms