Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COCHO43405 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COCHO43405 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COCHO43405 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COCHO43405 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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