Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSI1O43347 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms