Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BMM5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BMM5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms