Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9PCH4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PCH4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PCH4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E9PCH4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms