Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA1C9JL84 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms