Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms