Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms