Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VWA8A3KMH1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms