Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms