Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL27Q9Y4X3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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