Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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HDGFL3Q9Y3E1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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